El papel más importante relacionado con la ingesta de proteínas tiene que ver con el mantenimiento de la masa muscular, y de manera más concreta con los procesos de recuperación y/o incremento de la masa muscular después del ejercicio físico moderado/intenso o prolongado.

La participación de las proteínas como fuente de energía en ejercicios aeróbicos de moderada a alta intensidad debería ser mínima, siempre y cuando se hayan consumido las cantidades de hidratos de carbono adecuadas antes, durante y después de la actividad, para evitar que estas se agoten y si inicie el consumo de proteínas para la obtención de energía.